Ich habe mal bei frischen Installationen die Paket Listen verglichen.
Diese Pakete fehlen bei der Installationen ohne Drittanbieter-Software.

Eventuell einfach alle installieren oder erst mal alle gstreamer.
Code:
chromium-codecs-ffmpeg-extra
flashplugin-installer
freepats
gstreamer1.0-fluendo-mp3:amd64
gstreamer1.0-libav:amd64
gstreamer1.0-plugins-bad:amd64
gstreamer1.0-plugins-bad-faad:amd64
gstreamer1.0-plugins-bad-videoparsers:amd64
gstreamer1.0-plugins-ugly:amd64
gstreamer1.0-plugins-ugly-amr:amd64
libasound2-plugins:amd64
libavfilter-ffmpeg5:amd64
libavresample-ffmpeg2:amd64
libchromaprint0:amd64
libdc1394-22:amd64
libde265-0:amd64
libflite1:amd64
libgstreamer-plugins-bad1.0-0:amd64
libgtkglext1:amd64
libilmbase12:amd64
libjasper1:amd64
libkate1:amd64
libmimic0:amd64
libmjpegutils-2.1-0
libmpeg2encpp-2.1-0
libmplex2-2.1-0
libofa0:amd64
libopencore-amrnb0:amd64
libopencore-amrwb0:amd64
libopencv-calib3d2.4v5:amd64
libopencv-contrib2.4v5:amd64
libopencv-core2.4v5:amd64
libopencv-features2d2.4v5:amd64
libopencv-flann2.4v5:amd64
libopencv-highgui2.4v5:amd64
libopencv-imgproc2.4v5:amd64
libopencv-legacy2.4v5:amd64
libopencv-ml2.4v5:amd64
libopencv-objdetect2.4v5:amd64
libopencv-video2.4v5:amd64
libopenexr22:amd64
libpango1.0-0:amd64
libpangox-1.0-0:amd64
libsbc1:amd64
libsidplay1v5
libsodium18:amd64
libsoundtouch1:amd64
libspandsp2:amd64
libspeexdsp1:amd64
libsrtp0
libtbb2:amd64
libvo-aacenc0:amd64
libvo-amrwbenc0:amd64
libwildmidi-config
libwildmidi1:amd64
libzbar0:amd64
libzmq5:amd64
oxideqt-codecs-extra:amd64
ubuntu-restricted-addons
@cobi
Soweit ich das noch weiß, basiert SmartMKVmerge auf MKVtoolnix.
Ich hoffe auch, das avidemux3 in Zukunft das Schneiden komplett abbilden kann.